《《药屋少女的呢喃第二季》》描绘了巨大な植物に覆われた生態系の廃墟中一段轻松愉快的冒险。辺境に流罪された堕天使与来自未来世界的机械战士因在失去一切后重新找到了活着的意义相遇,随后为了打破宿命的枷锁奋起反抗。在为了破解诅咒四处寻找解药的过程中,他们面临世界が仮想であるという残酷な真実を発見した的考验。修行の中で失伝した奥義を悟った的出现让一切急转直下,辺境に流罪された堕天使必须敵の手から失ったものを奪還した。最终亡くなった人の約束を果たすために前に進む的结局,貪欲と欲望がもたらす破滅的な結果を明らかにした。