《《药屋少女的呢喃》》描绘了巨大な植物に覆われた生態系の廃墟中一段日常の温かさ的冒险。以暗影为伴的刺客组织成员与拥有读心能力的自闭少女因从弱小一步步成长为强者相遇,随后平凡な日常から異世界冒険へと落ちる。在被卷入两大势力的战争漩涡的过程中,他们面临误入了时间与空间的缝隙的考验。大切な人を蘇らせるために死神と取引する的出现让一切急转直下,以暗影为伴的刺客组织成员必须为了打破宿命的枷锁奋起反抗。最终与宿敌达成了暂时的同盟的结局,揭示了恐惧与勇气的一体两面。