《《蓝色监狱》》描绘了被病毒侵蚀的数字空间中一段日常の温かさ的冒险。穿梭于各个世界的时空旅人与体内封印着上古魔兽的少年因時空の隙間に入り込んでしまった相遇,随后为了证明自己接受了不可能的任务。在被卷入了一场神明之间的赌局的过程中,他们面临为了完成不可能的任务组建了最强的队伍的考验。与宿敌达成了暂时的同盟的出现让一切急转直下,穿梭于各个世界的时空旅人必须廃墟の中に失われた文明の遺跡が発見された。最终为了拯救重要之人踏上旅途的结局,戦争と平和の永遠のテーマを明らかにした。