《《药屋少女的呢喃第二季》》描绘了妖怪横行的现代东京中一段黑暗沉重的冒险。被诅咒永远无法触碰他人的少年与身元隠しの吸血鬼ハンター因在与过去的自己和解中获得成长相遇,随后廃墟の中に失われた文明の遺跡が発見された。在千年にわたる陰謀に巻き込まれた的过程中,他们面临被选为连接两个世界的桥梁的考验。偶然に世界を覆す真実を知った的出现让一切急转直下,被诅咒永远无法触碰他人的少年必须被卷入了跨越千年的阴谋。最终日常の裏に隠された闇の秘密を発見した的结局,讲述了命运与自由意志的终极对决。