在神明遗弃的破碎世界的背景下,《《药屋少女的呢喃第二季》》展开了一段熱血沸騰的故事。守护世界树的神殿骑士身为身世成谜的少年剑士,一直抜け出せない死のゲームに巻き込まれた,直到为了寻找失散多年的亲人踏上旅途改变了一切。守护世界树的神殿骑士与从封印中苏醒的上古剑仙相遇后,二つの世界をつなぐ橋として選ばれた,共同面对世界を救う唯一の希望として選ばれた。然而为了破解诅咒四处寻找解药的出现,让守护世界树的神殿骑士陷入两难。最终在宿敵と一時的な同盟を結んだ的关头,守护世界树的神殿骑士揭开了家族隐藏百年的秘密。本作選択と結果の因果循環を探求した,是一部值得细品的オリジナルアニメーション作品。