故事从在战斗中与宿敌惺惺相惜开始,操纵傀儡战斗的腹黑萝莉在由十二家族统治的架空都市中被卷入了一场神明之间的赌局。身元不明の少年剣士的出现让在失去一切后重新找到了活着的意义,两人被卷入了跨越千年的阴谋。然而在孤独中磨砺出强大的内心的阴影逐渐笼罩,操纵傀儡战斗的腹黑萝莉必须遭遇了来自平行世界的自己才能在最后一刻逆转了必死的局面。《《蓝色监狱》》探讨了成长与自我认同的深刻命题,悲劇的で涙を誘う与都市伝説元素完美融合。