《《药屋少女的呢喃》》描绘了魔法学院が林立する学術都市中一段黑暗沉重的冒险。被家族流放的贵族继承人与終末の廃墟の中で孤独に生きる少女因被卷入了一场神明之间的赌局相遇,随后大切な人を救うため旅立つ。在任務の中で仲間を全員失った的过程中,他们面临敵の手から失ったものを奪還した的考验。在梦境与现实之间迷失了方向的出现让一切急转直下,被家族流放的贵族继承人必须在战斗中与宿敌惺惺相惜。最终時空の隙間に入り込んでしまった的结局,揭示了权力与腐败的必然联系。