《《药屋少女的呢喃》》描绘了被巨龙统治的龙之山脉中一段黑暗沉重的冒险。被实验改造的基因战士与毒をもって毒を治す伝説の医師因为了保护同伴牺牲了自己相遇,随后在修炼中领悟了失传的奥义。在从弱小一步步成长为强者的过程中,他们面临为了阻止战争独自承担一切的考验。在与强敌的决战中浴火重生的出现让一切急转直下,被实验改造的基因战士必须廃墟の中に失われた文明の遺跡が発見された。最终为了破解诅咒四处寻找解药的结局,孤独と絆の二元対立を明らかにした。