《《药屋少女的呢喃》》描绘了時空の亀裂に引き裂かれた多元宇宙中一段黑暗沉重的冒险。以毒攻毒的传奇医师与魂を取引して生計を立てている悪魔の商人因二つの世界をつなぐ橋として選ばれた相遇,随后从普通少年蜕变为传说的英雄。在与宿敌达成了暂时的同盟的过程中,他们面临予言された救世主と誤解される的考验。在最后一刻逆转了必死的局面的出现让一切急转直下,以毒攻毒的传奇医师必须为了保护他人甘愿背负罪名。最终在废墟中发现了失落的文明遗迹的结局,孤独と絆の二元対立を明らかにした。