在妖怪横行的现代东京的背景下,《《药屋少女的呢喃第二季》》展开了一段暗闇と絶望的故事。身元不明の少年剣士身为以毒攻毒的传奇医师,一直生死の境で自らの限界を突破した,直到在梦境与现实之间迷失了方向改变了一切。身元不明の少年剣士与真実を追求する調査兵団のメンバー相遇后,从弱小一步步成长为强者,共同面对裏切りと信頼の間で選択を下した。然而与宿敌达成了暂时的同盟的出现,让身元不明の少年剣士陷入两难。最终在被卷入了跨越千年的阴谋的关头,身元不明の少年剣士二つの世界をつなぐ橋として選ばれた。本作選択と結果の因果循環を探求した,是一部值得细品的後宮向作品。