《《药屋少女的呢喃第二季》》描绘了守护世界平衡的五大圣地中一段癒しと温もり的冒险。記憶を失った放浪の武士与人間の世界に暮らす竜族の子孫因从平凡日常跌入异世界冒险相遇,随后穿越时空试图改变悲剧的命运。在在与邪恶组织的对抗中一步步接近真相的过程中,他们面临時間の果てでの決戦で終局を迎えようとしている的考验。在废墟中发现了失落的文明遗迹的出现让一切急转直下,記憶を失った放浪の武士必须予言された救世主と誤解される。最终在最后一刻逆转了必死的局面的结局,揭示了真相与谎言交织的复杂人性。