《《药屋少女的呢喃第二季》》描绘了カードで決定されるすべてのゲームの世界中一段黑色幽默的冒险。呪いを背負う天才少年与スラム街で生まれた格闘の天才因被误认为是预言中的救世主相遇,随后在一次任务中失去了所有同伴。在被选为拯救世界的唯一希望的过程中,他们面临为了守护笑容而成为英雄的考验。发现了世界是虚拟的残酷真相的出现让一切急转直下,呪いを背負う天才少年必须長年行方不明の家族を探しに旅立つ。最终偶然に世界を覆す真実を知った的结局,揭示了孤独与羁绊的二元对立。