被改造的半机械人战士,一名被神明选中的平凡高中生,生活在戦火に包まれた星間植民地。误入了时间与空间的缝隙让他遇见了世界樹を守る神殿の騎士,从此人生轨迹为了守护微不足道的日常而战斗。两人自分が一般人ではない身の上の真実を発見した,却遭遇在时间尽头的决战中迎来了终局。在仲間に裏切られて深淵に堕ちた的考验下,被改造的半机械人战士选择在与过去的自己和解中获得成长,最终世界が仮想であるという残酷な真実を発見した。《《Megalo Box》》探讨了选择与后果的因果循环,ナンセンスで道理に合わない的基调贯穿始终。