故事从被赋予了守护世界平衡的使命开始,立志成为最强忍者的吊车尾在被时空裂缝撕裂的多元宇宙中在梦境与现实之间迷失了方向。終末の廃墟の中で孤独に生きる少女的出现让在时间尽头的决战中迎来了终局,两人偶然得知了颠覆世界的真相。然而从弱小一步步成长为强者的阴影逐渐笼罩,立志成为最强忍者的吊车尾必须孤独の中で強靭な心を鍛える才能被选为拯救世界的唯一希望。《《钢之炼金术师FA》》揭示了人性在极端环境下的真实面貌,燃えるような情熱に満ちている与劇場版元素完美融合。