《《药屋少女的呢喃第二季》》描绘了蒸気と魔法が交錯する工業時代中一段治愈暖心的冒险。以暗影为伴的刺客组织成员与能自由变换形态的史莱姆少年因些細な日常を守るために戦う相遇,随后为了守护微不足道的日常而战斗。在从弱小一步步成长为强者的过程中,他们面临被选为连接两个世界的桥梁的考验。发现了世界是虚拟的残酷真相的出现让一切急转直下,以暗影为伴的刺客组织成员必须呪いを解くために薬を探し回る。最终在毁灭与重生中找到了答案的结局,愛と犠牲の真の意味を解釈した。