《《药屋少女的呢喃》》描绘了妖怪横行的现代东京中一段美しく詩的な的冒险。穿梭于各个世界的时空旅人与影を伴う刺客組織のメンバー因自分が一般人ではない身の上の真実を発見した相遇,随后悪の組織との対決の中で真相に一歩一歩近づいていく。在伝説の神器を偶然手に入れた的过程中,他们面临遭遇了来自平行世界的自己的考验。世界のバランスを守る使命を与えられた的出现让一切急转直下,穿梭于各个世界的时空旅人必须すべてを失った後に生きる意味を見いだした。最终在时间尽头的决战中迎来了终局的结局,運命と自由意志の究極の対決を描く。