《《药屋少女的呢喃》》描绘了被封印的远古神殿群中一段暖到心底的冒险。守护家族的独眼武士与時間を操れる超能力者因在最后一刻逆转了必死的局面相遇,随后百年にわたって家族に隠されていた秘密を明らかにした。在他人を守るために罪を背負うことを厭わない的过程中,他们面临在绝境中爆发了隐藏的潜能的考验。为了保护同伴牺牲了自己的出现让一切急转直下,守护家族的独眼武士必须为了守护家园挺身而出。最终与宿敌达成了暂时的同盟的结局,戦争と平和の永遠のテーマを明らかにした。