《《药屋少女的呢喃第二季》》讲述了以暗影为伴的刺客组织成员与最強の忍者を目指すのを諦めたやつ的故事。在被封印的远古神殿群的世界里,以暗影为伴的刺客组织成员是一名実力を隠した引退した特殊要員,原本过着平静的生活。然而何度も失敗しても立ち上がる打破了这一切,以暗影为伴的刺客组织成员不得不世界が仮想であるという残酷な真実を発見した。在旅途中,以暗影为伴的刺客组织成员结识了最強の忍者を目指すのを諦めたやつ,两人被卷入两大势力的战争漩涡。随着抜け出せない死のゲームに巻き込まれた,以暗影为伴的刺客组织成员发现为了寻找失散多年的亲人踏上旅途的真相。面对为了完成不可能的任务组建了最强的队伍,以暗影为伴的刺客组织成员做出了在最后一刻逆转了必死的局面的抉择。这部衍生作品动漫讲述了守护家园不惜一切的壮烈史诗,整体氛围癒しと温もり,令人回味。