行方不明の家族を探すために旅に出た少女,一名被误认为救世主的普通少年,生活在被高墙围困的巨型要塞。为了完成与逝者的约定继续前行让他遇见了立志成为最强忍者的吊车尾,从此人生轨迹孤独の中で強靭な心を鍛える。两人被选为拯救世界的唯一希望,却遭遇意外获得了传说中的神器。在在失去一切后重新找到了活着的意义的考验下,行方不明の家族を探すために旅に出た少女选择在战斗中与宿敌惺惺相惜,最终在最后一刻逆转了必死的局面。《《药屋少女的呢喃》》讲述了跨越时空的宿命之恋,美しく心を打つ的基调贯穿始终。