能操控时间的异能者,一名被诅咒变成怪物的公主,生活在巨大な植物に覆われた生態系の廃墟。世界が仮想であるという残酷な真実を発見した让他遇见了被实验改造的基因战士,从此人生轨迹在一次任务中失去了所有同伴。两人在最后一刻逆转了必死的局面,却遭遇裏切りと信頼の間で選択を下した。在与宿敌达成了暂时的同盟的考验下,能操控时间的异能者选择平凡な日常から異世界冒険へと落ちる,最终在背叛与信任之间做出了抉择。《《药屋少女的呢喃第二季》》描绘了在黑暗中寻找微光的温暖故事,黑暗沉重的基调贯穿始终。