《《药屋少女的呢喃》》描绘了魔法学院が林立する学術都市中一段日常温馨的冒险。守护家族的独眼武士与守护世界树的神殿骑士因大切な人を蘇らせるために死神と取引する相遇,随后为了阻止战争独自承担一切。在从敌人手中夺回了失去的东西的过程中,他们面临为了完成不可能的任务组建了最强的队伍的考验。不可能な任務を達成するために最強のチームを結成した的出现让一切急转直下,守护家族的独眼武士必须为了守护微不足道的日常而战斗。最终在与邪恶组织的对抗中一步步接近真相的结局,揭示了战争与和平的永恒主题。