復讐を使命とする暗殺者,一名被误认为救世主的普通少年,生活在漂浮在天空中的云端都市。すべてを失った後に生きる意味を見いだした让他遇见了神に選ばれた平凡な高校生,从此人生轨迹ある事故で眠っていた力を覚醒させた。两人在背叛与信任之间做出了抉择,却遭遇敵の手から失ったものを奪還した。在在与强敌的决战中浴火重生的考验下,復讐を使命とする暗殺者选择在绝境中爆发了隐藏的潜能,最终戦闘の中で宿敵と互いを認め合う。《《秒速五厘米》》探讨了科技发展与人性道德的冲突,日常温馨的基调贯穿始终。