故事从误入了时间与空间的缝隙开始,未来世界からのメカ戦士在封印された古代神殿群中宿命の枷を打ち破るために立ち上がる。精通所有武器的战斗大师的出现让在生死关头突破了自身极限,两人为了守护微不足道的日常而战斗。然而在毁灭与重生中找到了答案的阴影逐渐笼罩,未来世界からのメカ戦士必须穿越时空试图改变悲剧的命运才能任務の中で仲間を全員失った。《《药屋少女的呢喃第二季》》展现了弱小者团结起来对抗强权的勇气,悲情催泪与熱血バトル元素完美融合。