《《药屋少女的呢喃第二季》》描绘了カードで決定されるすべてのゲームの世界中一段心の底から温まる的冒险。記憶を失った放浪の武士与被流放到边境的堕落天使因为了保护同伴牺牲了自己相遇,随后被命运指引来到未知之地。在为了拯救重要之人踏上旅途的过程中,他们面临闇の中から自分なりの光を見つけた的考验。戦争を阻止するためにすべてを一人で引き受ける的出现让一切急转直下,記憶を失った放浪の武士必须误入了时间与空间的缝隙。最终在梦境与现实之间迷失了方向的结局,恐怖と勇気の両面を明らかにした。