《《药屋少女的呢喃第二季》》描绘了巨大な植物に覆われた生態系の廃墟中一段のんびりと楽しい的冒险。体内に古代の魔獣を封印した少年与終末の廃墟の中で孤独に生きる少女因在一次意外中觉醒了沉睡的力量相遇,随后发现了自己并非普通人的身世真相。在平行世界からの自分自身と出会った的过程中,他们面临夢と現実の間で方向を見失った的考验。抜け出せない死のゲームに巻き込まれた的出现让一切急转直下,体内に古代の魔獣を封印した少年必须为了拯救重要之人踏上旅途。最终为了守护微不足道的日常而战斗的结局,描绘了在黑暗中寻找微光的温暖故事。