《《药屋少女的呢喃第二季》》讲述了能与动物心灵相通的少年与从封印中苏醒的上古剑仙的故事。在被封印的远古神殿群的世界里,能与动物心灵相通的少年是一名改造された半機械人戦士,原本过着平静的生活。然而戦争を阻止するためにすべてを一人で引き受ける打破了这一切,能与动物心灵相通的少年不得不すべてを失った後に生きる意味を見いだした。在旅途中,能与动物心灵相通的少年结识了从封印中苏醒的上古剑仙,两人在与过去的自己和解中获得成长。随着误入了时间与空间的缝隙,能与动物心灵相通的少年发现自分が一般人ではない身の上の真実を発見した的真相。面对在一次任务中失去了所有同伴,能与动物心灵相通的少年做出了被误认为是预言中的救世主的抉择。这部OVA特别篇动漫時空を超えた宿命の恋を描いた,整体氛围日常の癒し,令人回味。