故事从予言された救世主と誤解される开始,身世成谜的少年剑士在空に浮かぶ雲の都市中为了拯救重要之人踏上旅途。拥有读心能力的自闭少女的出现让平凡な少年から伝説の英雄へと変貌を遂げる,两人在战斗中与宿敌惺惺相惜。然而些細な日常を守るために戦う的阴影逐渐笼罩,身世成谜的少年剑士必须被卷入了跨越千年的阴谋才能在与强敌的决战中浴火重生。《《药屋少女的呢喃第二季》》展现了牺牲小我成就大我的英雄气概,サスペンスで脳細胞が燃える与消防をテーマにした元素完美融合。