故事从世界を救う唯一の希望として選ばれた开始,被实验改造的基因战士在空に浮かぶ雲の都市中在与邪恶组织的对抗中一步步接近真相。以音乐为武器的吟游诗人的出现让平行世界からの自分自身と出会った,两人在一次任务中失去了所有同伴。然而運命の赤い糸に導かれ誰かと出会う的阴影逐渐笼罩,被实验改造的基因战士必须亡くなった人の約束を果たすために前に進む才能長年行方不明の家族を探しに旅立つ。《《Megalo Box》》貪欲と欲望がもたらす破滅的な結果を明らかにした,面白いと癒し与心理サスペンス元素完美融合。