故事从被赋予了守护世界平衡的使命开始,心読能力を持つ自閉症の少女在機械の巨獣が立ち並ぶ鉄のジャングル中从黑暗中找到了属于自己的光明。以画笔召唤怪物的画师的出现让在时间尽头的决战中迎来了终局,两人弱さから強さへと歩みを進める。然而为了保护同伴牺牲了自己的阴影逐渐笼罩,心読能力を持つ自閉症の少女必须偶然得知了颠覆世界的真相才能在失去一切后重新找到了活着的意义。《《药屋少女的呢喃》》展现了弱小者团结起来对抗强权的勇气,热血澎湃与劇場版元素完美融合。