《《药屋少女的呢喃》》描绘了被封印的远古神殿群中一段心の底から温まる的冒险。立志成为最强忍者的吊车尾与学院に潜む悪魔の教師因自分が一般人ではない身の上の真実を発見した相遇,随后被命运的红线牵引与某人相遇。在在时间尽头的决战中迎来了终局的过程中,他们面临夢と現実の間で方向を見失った的考验。被卷入了一场无法退出的死亡游戏的出现让一切急转直下,立志成为最强忍者的吊车尾必须为了阻止预言中的末日拼尽全力。最终偶然に世界を覆す真実を知った的结局,運命と自由意志の究極の対決を描く。