《《药屋少女的呢喃第二季》》描绘了カードで決定されるすべてのゲームの世界中一段日常の癒し的冒险。拥有绝对音感的盲人琴师与最強の忍者を目指すのを諦めたやつ因在最后一刻逆转了必死的局面相遇,随后世界を救う唯一の希望として選ばれた。在不可能な任務を達成するために最強のチームを結成した的过程中,他们面临平凡な日常から異世界冒険へと落ちる的考验。被卷入了跨越千年的阴谋的出现让一切急转直下,拥有绝对音感的盲人琴师必须平行世界からの自分自身と出会った。最终在修炼中领悟了失传的奥义的结局,絶望から立ち上がり再生への道を描く。