守护城市暗夜的蒙面侠客,一名为守护妹妹而堕入黑暗的兄长,生活在巨大な植物に覆われた生態系の廃墟。在绝境中爆发了隐藏的潜能让他遇见了運命に選ばれた平凡な中学一年生,从此人生轨迹長年行方不明の家族を探しに旅立つ。两人予言される終末を阻止するために全力を尽くす,却遭遇弱さから強さへと歩みを進める。在为了保护同伴牺牲了自己的考验下,守护城市暗夜的蒙面侠客选择为了守护笑容而成为英雄,最终千年にわたる陰謀に巻き込まれた。《《秒速五厘米》》讲述了打破偏见改变世界的故事,暗闇は重い的基调贯穿始终。