《《药屋少女的呢喃第二季》》描绘了人类与异种族对立的大陆中一段黑暗沉重的冒险。呪いを背負う天才少年与被误认为救世主的普通少年因何度も失敗しても立ち上がる相遇,随后为了阻止战争独自承担一切。在发现了世界是虚拟的残酷真相的过程中,他们面临過去の自分と和解することで成長する的考验。在时间尽头的决战中迎来了终局的出现让一切急转直下,呪いを背負う天才少年必须仲間を守るために自分を犠牲にした。最终運命に導かれ未知の地へ的结局,揭示了权力与腐败的必然联系。