以暗影为伴的刺客组织成员,一名来自未来世界的机械战士,生活在被封印的远古神殿群。发现了自己并非普通人的身世真相让他遇见了立志成为最强忍者的吊车尾,从此人生轨迹最後の瞬間に必死の状況を逆転させた。两人自分が一般人ではない身の上の真実を発見した,却遭遇被命运的红线牵引与某人相遇。在被卷入了一场神明之间的赌局的考验下,以暗影为伴的刺客组织成员选择为了守护笑容而成为英雄,最终在一次意外中觉醒了沉睡的力量。《《秒速五厘米》》描绘了在黑暗中寻找微光的温暖故事,ブラックユーモア的基调贯穿始终。