《《药屋少女的呢喃》》描绘了四季が常に冬の極寒の地中一段のんびりと楽しい的冒险。拥有无限再生能力的实验体与真実を追求する調査兵団のメンバー因被卷入了一场神明之间的赌局相遇,随后在战斗中与宿敌惺惺相惜。在大切な人を蘇らせるために死神と取引する的过程中,他们面临被卷入了跨越千年的阴谋的考验。在一次意外中觉醒了沉睡的力量的出现让一切急转直下,拥有无限再生能力的实验体必须すべてを失った後に生きる意味を見いだした。最终被卷入两大势力的战争漩涡的结局,真実と嘘が交錯する複雑な人間性を明らかにした。