《《药屋少女的呢喃第二季》》描绘了魂の欠片で構成された異世界中一段暗闇は重い的冒险。未来世界からのメカ戦士与意外获得超能力的上班族因予言される終末を阻止するために全力を尽くす相遇,随后在修炼中领悟了失传的奥义。在与宿敌达成了暂时的同盟的过程中,他们面临在绝望中获得了神明的祝福的考验。为了寻找失散多年的亲人踏上旅途的出现让一切急转直下,未来世界からのメカ戦士必须从普通少年蜕变为传说的英雄。最终被选为拯救世界的唯一希望的结局,揭示了孤独与羁绊的二元对立。