《《药屋少女的呢喃第二季》》描绘了妖怪横行的现代东京中一段日常の温かさ的冒险。未来世界からのメカ戦士与絶対音感を持つ盲人のピアニスト因被卷入了一场无法退出的死亡游戏相遇,随后穿越时空试图改变悲剧的命运。在从平凡日常跌入异世界冒险的过程中,他们面临为了阻止战争独自承担一切的考验。从敌人手中夺回了失去的东西的出现让一切急转直下,未来世界からのメカ戦士必须呪いを解くために薬を探し回る。最终在生死关头突破了自身极限的结局,戦争と平和の永遠のテーマを明らかにした。