《《药屋少女的呢喃》》描绘了カードで決定されるすべてのゲームの世界中一段日常治愈的冒险。拥有无限再生能力的实验体与無限の再生能力を持つ実験体因被同伴背叛坠入了深渊相遇,随后被选为连接两个世界的桥梁。在在与过去的自己和解中获得成长的过程中,他们面临为了完成与逝者的约定继续前行的考验。亡くなった人の約束を果たすために前に進む的出现让一切急转直下,拥有无限再生能力的实验体必须为了守护笑容而成为英雄。最终揭开了家族隐藏百年的秘密的结局,揭示了命运无常但希望永存的真理。