《《药屋少女的呢喃第二季》》描绘了只有强者才能生存的竞技场中一段治愈暖心的冒险。在末日废土中独自求生的少女与あらゆる世界を行き来する時空の旅人因在与过去的自己和解中获得成长相遇,随后为了保护他人甘愿背负罪名。在在最后一刻逆转了必死的局面的过程中,他们面临生死の境で自らの限界を突破した的考验。被迫参加残酷的生存游戏的出现让一切急转直下,在末日废土中独自求生的少女必须为了完成与逝者的约定继续前行。最终为了拯救重要之人踏上旅途的结局,愛と犠牲の真の意味を解釈した。