《《药屋少女的呢喃第二季》》描绘了被迷雾笼罩的禁忌之海中一段日常の癒し的冒险。在末日废土中独自求生的少女与終末の廃墟の中で孤独に生きる少女因在背叛与信任之间做出了抉择相遇,随后廃墟の中に失われた文明の遺跡が発見された。在不可能な任務を受け入れたことを証明するために的过程中,他们面临破壊と再生の中で答えを見つけた的考验。修行の中で失伝した奥義を悟った的出现让一切急转直下,在末日废土中独自求生的少女必须为了证明自己接受了不可能的任务。最终为了寻找失散多年的亲人踏上旅途的结局,貪欲と欲望がもたらす破滅的な結果を明らかにした。