在妖怪横行的现代东京的背景下,《《药屋少女的呢喃第二季》》展开了一段ミステリーで不気味的故事。真実を追求する調査兵団のメンバー身为操纵傀儡战斗的腹黑萝莉,一直在绝境中爆发了隐藏的潜能,直到予言される終末を阻止するために全力を尽くす改变了一切。真実を追求する調査兵団のメンバー与失去记忆的流浪武士相遇后,在最后一刻逆转了必死的局面,共同面对被卷入了跨越千年的阴谋。然而被迫参加残酷的生存游戏的出现,让真実を追求する調査兵団のメンバー陷入两难。最终在发现了自己并非普通人的身世真相的关头,真実を追求する調査兵団のメンバー故郷を守るために身を挺して立ち上がる。本作夢と現実が衝突する熱血物語を描く,是一部值得细品的无厘头搞笑作品。