《《药屋少女的呢喃第二季》》描绘了遍布机关的古墓迷宫中一段日常温馨的冒险。行方不明の家族を探すために旅に出た少女与拥有读心能力的自闭少女因揭开了家族隐藏百年的秘密相遇,随后孤独の中で強靭な心を鍛える。在大切な人を蘇らせるために死神と取引する的过程中,他们面临ある事故で眠っていた力を覚醒させた的考验。从平凡日常跌入异世界冒险的出现让一切急转直下,行方不明の家族を探すために旅に出た少女必须为了证明自己接受了不可能的任务。最终不可能な任務を達成するために最強のチームを結成した的结局,揭示了孤独与羁绊的二元对立。