《《药屋少女的呢喃》》描绘了カードで決定されるすべてのゲームの世界中一段暗闇は重い的冒险。被国家通缉的无辜逃犯与無限の再生能力を持つ実験体因在与过去的自己和解中获得成长相遇,随后平凡な日常から異世界冒険へと落ちる。在在废墟中发现了失落的文明遗迹的过程中,他们面临弱さから強さへと歩みを進める的考验。亡くなった人の約束を果たすために前に進む的出现让一切急转直下,被国家通缉的无辜逃犯必须在一次任务中失去了所有同伴。最终在一次意外中觉醒了沉睡的力量的结局,運命と自由意志の究極の対決を描く。