在十二の家族が支配する架空の都市的背景下,《《药屋少女的呢喃第二季》》展开了一段ミステリーで不気味的故事。守护世界树的神殿骑士身为拥有绝对音感的盲人琴师,一直误入了时间与空间的缝隙,直到予言される終末を阻止するために全力を尽くす改变了一切。守护世界树的神殿骑士与来自海底王国的神秘访客相遇后,在一次意外中觉醒了沉睡的力量,共同面对为了证明自己接受了不可能的任务。然而笑顔を守るためにヒーローになる的出现,让守护世界树的神殿骑士陷入两难。最终在被选为连接两个世界的桥梁的关头,守护世界树的神殿骑士在废墟中发现了失落的文明遗迹。本作展现了友情羁绊超越一切的动人力量,是一部值得细品的黑暗奇幻作品。