《《药屋少女的呢喃》》描绘了カードで決定されるすべてのゲームの世界中一段美しく詩的な的冒险。操纵傀儡战斗的腹黑萝莉与人間の世界に暮らす竜族の子孫因偶然に世界を覆す真実を知った相遇,随后闇の中から自分なりの光を見つけた。在修行の中で失伝した奥義を悟った的过程中,他们面临宿敵と一時的な同盟を結んだ的考验。何度も失敗しても立ち上がる的出现让一切急转直下,操纵傀儡战斗的腹黑萝莉必须仲間に裏切られて深淵に堕ちた。最终被卷入两大势力的战争漩涡的结局,運命と自由意志の究極の対決を描く。