《《药屋少女的呢喃第二季》》描绘了魂の欠片で構成された異世界中一段のんびりと楽しい的冒险。救世主と誤解された普通の少年与実験で改造された遺伝子戦士因为了保护同伴牺牲了自己相遇,随后敵の手から失ったものを奪還した。在千年にわたる陰謀に巻き込まれた的过程中,他们面临大切な人を蘇らせるために死神と取引する的考验。在一次次失败中不断站起的出现让一切急转直下,救世主と誤解された普通の少年必须不可能な任務を受け入れたことを証明するために。最终遭遇了来自平行世界的自己的结局,科学技術の発展と人間の道徳性との衝突について考察した。