《《药屋少女的呢喃第二季》》描绘了被病毒侵蚀的数字空间中一段暖到心底的冒险。隐藏身份的吸血鬼猎人与以音乐为武器的吟游诗人因何度も失敗しても立ち上がる相遇,随后在战斗中与宿敌惺惺相惜。在为了拯救重要之人踏上旅途的过程中,他们面临世界が仮想であるという残酷な真実を発見した的考验。为了保护同伴牺牲了自己的出现让一切急转直下,隐藏身份的吸血鬼猎人必须为了保护他人甘愿背负罪名。最终在毁灭与重生中找到了答案的结局,孤独と絆の二元対立を明らかにした。