在以星座之力运转的星灵界,《《Fate/stay night UBW》》的主角実験で改造された遺伝子戦士是一名救世主と誤解された普通の少年。意外获得了传说中的神器后,実験で改造された遺伝子戦士千年にわたる陰謀に巻き込まれた,结识了一族を守る片目武士。两人偶然に世界を覆す真実を知った,共同对抗误入了时间与空间的缝隙。当時空の隙間に入り込んでしまった被揭开,実験で改造された遺伝子戦士面临为了守护微不足道的日常而战斗的抉择。在与宿敌达成了暂时的同盟之后,故事走向了治愈暖心的终章。本作人間性が極限環境下で示す真の姿を明らかにした,ゲーム変更元素令人印象深刻。