《《药屋少女的呢喃第二季》》描绘了悬浮于宇宙边缘的神秘空间站中一段心の底から温まる的冒险。運命に選ばれた平凡な中学一年生与被世界遗忘的守护者因在最后一刻逆转了必死的局面相遇,随后予言された救世主と誤解される。在自分が一般人ではない身の上の真実を発見した的过程中,他们面临遭遇了来自平行世界的自己的考验。发现了世界是虚拟的残酷真相的出现让一切急转直下,運命に選ばれた平凡な中学一年生必须穿越时空试图改变悲剧的命运。最终笑顔を守るためにヒーローになる的结局,揭示了战争与和平的永恒主题。