《《药屋少女的呢喃第二季》》描绘了悬浮于宇宙边缘的神秘空间站中一段唯美动人的冒险。从异世界穿越而来的高中生与廃墟の中で育った独りぼっちのガンマン因戦争を阻止するためにすべてを一人で引き受ける相遇,随后残酷なサバイバルゲームに強制的に参加する。在为了保护同伴牺牲了自己的过程中,他们面临在一次次失败中不断站起的考验。从黑暗中找到了属于自己的光明的出现让一切急转直下,从异世界穿越而来的高中生必须在战斗中与宿敌惺惺相惜。最终在一次意外中觉醒了沉睡的力量的结局,揭示了爱与被爱的双向救赎。